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李经述将调查结果发给了《纽约时报》与《泰晤士报》刊登，引起了世界舆论的强烈反响。俄国人被激怒了，认为日本人是故意愚弄他们，要求沙皇立即对日本开战。
日本首相大隈重信恳求沙俄政府宽限时日，等待日本法律的判决，他承诺一定将凶手绳之以法，处以最严厉的刑罚。为维系两国关系，日本首相大隈重信连夜召开内阁紧急会议，会上达成一致意见，以“大逆罪”处决罪犯津田三藏死刑，日方承担国际法上的政府责任，同时将内阁善后决定向日本明治天皇通报。日本天皇下令日本最高司法机关大审院火速组成特别法庭，对“大津案”进行审理。不过，日本司法机关与力主从严、从快、从重的政府行政机关，很快就如何适用刑法，产生严重分歧。
当时的日本西化未久，在国际间仍然是一個国小力弱不起眼的小国，日本向來沒有三權分立的传统，獨立的司法体系是在1890年日本宪法之下才誕生，才满一年就遭到如此重大的考验。
日本内阁以案件牵涉日俄外交关系，俄国随时可能发动战争，且早有两国约定为由，主张非重判不可。新任大审院院长儿岛惟谦则就法言法，他提出，日本刑法第116条规定，凡加害日本天皇、皇后、皇太子等皇室成员者，不分未遂即遂，一律处以死刑。但这条加害皇室罪俗称“大逆罪”，只适用于保护日本皇室成员的人身安全，而非访日的外国皇室成员，后者地位与普通日本国民无异。本案只能按照普通杀人未遂罪，处以被告终身监禁。
面对日本首相大隈重信的亲自诘问，新任大审院院长儿岛惟谦搬出大隈重信自己牵头制定的《明治宪法》，义正言辞说：“宪法规定政府施政必须完全遵守法律，不得玩弄法律于股掌间。我们当法官的，维护法律的尊严，就是维护国民的尊严！”
日本首相大隈重信自己也很为难，几乎用央求的语气对儿岛惟谦院长说：“我何尝不知道法律代表国民的尊严，但是事态紧急，搞不好日本有灭国之灾，还请法网开一面。”
儿岛惟谦不以为然，拒绝道：“法网恢恢，疏而不漏，要是开了口子，那以后漏网之鱼就会如过江之鲤。”
日本首相大隈重信疾呼“日本离亡国不远矣！你将是日本的罪人！老夫只好去见天皇，求他下令了。”
