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那个地方，存储着数量不菲的绫波丽克隆体，现在碇源渡要去看看能不能唤醒一号，将莉莉丝的灵魂重新唤醒融入到绫波丽的复制体之中。
本来，拥有这种大杀器在手，碇源渡根本就一点都不担心，因为只有他掌握了这种让绫波丽复活的方法，所以他根本就不担心莉莉丝的灵魂会消失。
但是，当他试图唤醒一号备用身体的时候却发现，他没法唤醒一号，也就是说，零号根本就没有死。
虽然他能够将莉莉丝的灵魂召唤回来，让她进入特定的身体之中，但现在零号还没有死呢。零号都没死，莉莉丝的灵魂自然不会离开零号的身体，而莉莉丝的灵魂不离开，他自然也就无法召唤了。
这一下，碇源渡有点慌了，因为这件事已经超出了他的掌控了。
如果没有莉莉丝的话，人类补完就无法实行，如果人类补完无法实行的话，他就无法借助亚当的成神，无法重新跟他逝去的妻子重逢。
碇源渡所在的一切，其实都是为了跟自己当年因为实验发生意外消失在初号机当中的妻子重逢，也正是因为如此，他要实施的其实并不是人类补完计划，亦或者说并不是单纯的人类补完计划。
他要做的事情，其实是想要让初号机成神，然后自己在借助移植到自己手臂当中的亚当肉身成神，这样他跟他的妻子将会成为新的亚当跟莉莉丝。
